九州大學是日本原七個帝國大學之一，目前已成為日本著名的國立大學，在日本以及世界上均占有一定的地位。東京大學和京都大學建立后，日本國內就有再在九州建立一所帝國大學的提議。

1903年4月京都帝國大學的分部京都帝國大學福岡醫科大學成立，這就是九州大學的前身。當時由于國家百廢待興，從財政、購地、校舍建筑各方面均力不從心，所以在8年之后也就是1911年方正式掛出九州帝國醫科大學，同時還設有九州帝國工科大學，這是今天九州大學能成為綜合性大學的基礎。1947年改名為九州大學。1949年，包含位于福岡地區的舊制九州大學，再加上九州大學附屬醫學專門部、福岡高等學校、久留米工業專門學校成為新制的九州大學。舊福岡高等學校的設施與教職員并入九州大學第一分校（1955年與第二分校整合為九州大學分校，1963年開始稱為教養部），舊久留米工業專門學校設為第二分校（1955年與第一分校合并），舊陸軍步兵第四十八連隊兵舍遺址則設為第三分校（于1951年廢止）。2003年根據法律第29號吸收九州藝術工科大學，2004年根據國立大學法人化，從原本由國家直接設置管理的國立大學轉為國立大學法人。

九州大學校區相對比較集中，除了一些附屬研究設施和實習基地，如農場、林場、海洋火山觀察所等分布于九州及九州以外地區，教學、研究、行政基礎設施均在福岡市內。為了追趕新技術革命的迅猛發展形勢，日本政府近來把能源、宇宙科學、癌三大重點尖端研究項目交給基礎雄厚的幾所國立大學進行，九州大學亦是其中之一。比如在室內核聚變進行新能源開發這一項目中，日本政府每年不惜投資100億日元用于設備改造和加強研究力量。

九州大學的超導、等離子體有關部門積極加入了這一重大工程的研究。另外，在海洋、火山、地震預測方面，九州大學在日本西部九州地區有完善的預測網。在癌的研究上，生醫所已就癌的致因、診斷、治療等方面與其它大學合作，取得了可喜的進展。九州大學歷來有良好的學風，治學嚴謹，重視學生的實習和實踐，教師重視啟發式教學，畢業生十分受用人單位歡迎。可以毫不夸張地說，今天的九州大學已名副其實地成了日本西部地區一所舉足輕重的高等學府。

各學部 研究院

大學學部：

文學部

教育學部

法學部

經濟學部

理學部

醫學部

齒學部

藥學部

工學部

藝術工學部

農學部

學府/研究院：

人文科學府／研究院

比較社會文化學府／研究院

人間環境學府／研究院

法學府／研究院

法務學府

經濟學府／研究院

言語文化研究院

理學府／研究院

數理學府／研究院

醫學系學府／研究院

齒學府／研究院

藥學府／研究院

工學府／研究院

藝術工學府／研究院

系統資訊科學府／研究院

綜合理工學府／研究院

生物資源環境科學府

系統生命科學府

農學研究院

年表：

1903年 福岡醫科大學設立(京都帝國大學之分科大學)

1910年 九州帝國大學設立

1911年 九州帝國大學工科大學官制施行，以分科大學設立醫科大學工科大學

1919年 帝國大學令修改，各分科大學改制為醫學部與工學部，并設立農學部

1924年 設立法文學部 招收二名女學生

1939年 設立理學部

1947年 更名為九州大學

1949年 法文學部改組，后成為文學部、法學部、經濟學部、文學部，并從教育學部分離；福岡高等學校、久留米工業專門學校、舊制九州大學統合后成為新制九州大學及各分校

1953年 新制大學院(研究所)設置

1963年 分校經改組 設立教養部

1964年 設立藥學部

1967年 設立齒學部

1968年 九州藝術工科大學創立(現九州大學藝術工學部)

1994年 廢除教養部

1997年 醫學系研究科與工學研究科開始"大學院重點化"

2000年 大學院重點化之完成 同時引進學府、研究院制度，大學院(研究所)的所有研究科皆改組為研究院與學府

2003年 與九州藝術工科大學并校，成立藝術工學研究院、藝術工學府、藝術工學部

2004年 國立大學法人化，正式廢除九州藝術工科大學，并設立法務學府

2005年 開設伊都校區