京都帝國(guó)大學(xué)建立于1897年，當(dāng)時(shí)只設(shè)立了理工分科大學(xué)。在隨后的幾年中相繼設(shè)立了法，醫(yī)，文等分科大學(xué)以及附屬醫(yī)院和附屬圖書(shū)館，這樣學(xué)校初具規(guī)模。1919年分科大學(xué)改稱為學(xué)部。1947年由于新法的頒布，京都帝國(guó)大學(xué)被命名為京都大學(xué)。自那以后新的學(xué)部，大學(xué)院，研究中心相繼成立。現(xiàn)在京都大學(xué)擁有文學(xué)，教育學(xué)，法學(xué)，經(jīng)濟(jì)學(xué)，理學(xué)，醫(yī)學(xué)，藥學(xué)，工學(xué)，農(nóng)學(xué)，人間環(huán)境學(xué)，能源科學(xué)，亞非地區(qū)研究，情報(bào)學(xué)，生命科學(xué)，地球環(huán)境學(xué)堂學(xué)舍共15個(gè)大學(xué)院，綜合人間，文學(xué)，教育學(xué)，法學(xué)，經(jīng)濟(jì)學(xué)，理學(xué)，醫(yī)學(xué)，藥學(xué)，工學(xué)，農(nóng)學(xué)共10個(gè)學(xué)部，以及30多個(gè)研究所和研究中心。在過(guò)去的幾年中，京都大學(xué)為了適應(yīng)新世紀(jì)的需要，解決不斷出現(xiàn)的新問(wèn)題，把更多的重點(diǎn)放在大學(xué)院教育和研究上，并設(shè)立了新的大學(xué)院。

在其悠久的歷史中，京都大學(xué)大力發(fā)展人文，社會(huì)以及自然科學(xué)。信息技術(shù)和電氣工程實(shí)際應(yīng)用方面的創(chuàng)造性研究也已啟動(dòng)，在生物技術(shù)和能源科學(xué)等方面的先端應(yīng)用研究也成果不斷，并確保了研究成果回報(bào)社會(huì)。

京都大學(xué)的主校區(qū)臨近京都市中心。學(xué)部和先進(jìn)的實(shí)驗(yàn)室位于有百年歷史的紅磚房里。自然科學(xué)和能源研究機(jī)構(gòu)位于離主校區(qū)大約12公里的宇治校區(qū)。桂校區(qū)位于離主校區(qū)7公里遠(yuǎn)的西部，于2003年10月開(kāi)始建立。這個(gè)新校區(qū)由4個(gè)建筑群組成，旨在把技術(shù)和科學(xué)融合在一起，形成一個(gè)“科技園區(qū)”。現(xiàn)在工學(xué)研究科和情報(bào)學(xué)研究科正初步遷往桂校區(qū)。

京都大學(xué)的辦學(xué)理念為“自勵(lì)自學(xué)”，重視課堂上的獨(dú)特思考。學(xué)生可以自由地跨學(xué)科根據(jù)自己的興趣選課。少人數(shù)制的討論會(huì)向?qū)W生們開(kāi)放以激發(fā)他們對(duì)某一學(xué)科的興趣，不管他們所屬什么學(xué)部。期待通過(guò)討論會(huì)獲得的知識(shí)能拓寬他們的視野，深化他們的思維。同時(shí)為了幫助學(xué)生提高在當(dāng)今全球化的潮流中處于不敗之地所必需的語(yǔ)言能力以及信息獲得能力，學(xué)校也在努力強(qiáng)化完善這些方面的學(xué)科課程建設(shè)。此外，京都大學(xué)還提供實(shí)時(shí)遠(yuǎn)程教育，和加州大學(xué)合作舉辦了名為“跨越太平洋遠(yuǎn)程互動(dòng)教育計(jì)劃”（TIDE）。

京都大學(xué)是一所以研究為中心的大學(xué)，共有5名諾貝爾獎(jiǎng)獲得者，并在各個(gè)領(lǐng)域涌現(xiàn)了許多一流的研究者。在哲學(xué)方面，“京都學(xué)派”尤為著名。在其它領(lǐng)域也取得了許多先端性，開(kāi)拓性的成果。在21世紀(jì)面臨的全球環(huán)境問(wèn)題方面大量的調(diào)查研究正在進(jìn)行，在許多重要領(lǐng)域正在不斷取得進(jìn)步。

京都大學(xué)還致力于能源，食品以及和生命，福利有關(guān)問(wèn)題的研究。為了找到解決這些問(wèn)題的辦法，現(xiàn)有的研究部門和地球環(huán)境學(xué)堂在共同努力。在自然災(zāi)害領(lǐng)域，大學(xué)院的相關(guān)研究部門，研究所和研究中心在密切合作全力開(kāi)拓國(guó)際合作研究項(xiàng)目來(lái)保護(hù)人類的生命和財(cái)產(chǎn)。京都大學(xué)已在海外建立了據(jù)點(diǎn)從事傳統(tǒng)上的現(xiàn)地調(diào)查研究。東南亞研究所已經(jīng)在泰國(guó)曼谷和印度尼西亞雅加達(dá)設(shè)立了聯(lián)絡(luò)處。曼谷聯(lián)絡(luò)處設(shè)立于1963年，已發(fā)展成為一個(gè)大型的研究基地，覆蓋了整個(gè)泰國(guó)和周邊國(guó)家。雅加達(dá)聯(lián)絡(luò)處設(shè)立于1973年，不僅是一個(gè)信息收集中心，而且成為來(lái)自兩國(guó)學(xué)者的共同研究基地，并為印度尼西亞的研究者和學(xué)生提供了來(lái)日本（京都）深造的機(jī)會(huì)。

2002年12月，在經(jīng)濟(jì)學(xué)研究科內(nèi)設(shè)立了上海研究中心。2003年1月，在復(fù)旦大學(xué)內(nèi)設(shè)立了分所。中心的主要作用就是對(duì)當(dāng)前的中國(guó)以及中國(guó)和東亞經(jīng)濟(jì)圈的關(guān)系進(jìn)行研究。京都大學(xué)和復(fù)旦大學(xué)還有教師學(xué)生互訪項(xiàng)目。此外在下列領(lǐng)域培訓(xùn)高級(jí)專家的教育項(xiàng)目已經(jīng)啟動(dòng)。比如，舉辦有關(guān)中國(guó)和日本經(jīng)濟(jì)管理體制的講座。京都大學(xué)的先端研究獲得了國(guó)內(nèi)外的高度評(píng)價(jià)。COE（Center of Excellence）研究計(jì)劃，情報(bào)，能源學(xué)研究科，高新能源研究所等的海外研究機(jī)構(gòu)相繼在美國(guó)硅谷，泰國(guó)曼谷，中國(guó)北京等地設(shè)立了連鎖研究機(jī)構(gòu)。此外，生存圈研究所和生態(tài)學(xué)研究中心在泰國(guó)，馬來(lái)西亞，和印度尼西亞設(shè)立了實(shí)驗(yàn)室和現(xiàn)地觀察站進(jìn)行研究調(diào)查。

京都大學(xué)在很多科學(xué)領(lǐng)域正在致力于有組織有計(jì)劃的交流活動(dòng)，與國(guó)內(nèi)外的研究性大學(xué)締結(jié)合作協(xié)定。與世界各國(guó)的學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)進(jìn)行信息，人員的交流越來(lái)越多。比如，京都大學(xué)已成為21世紀(jì)COE項(xiàng)目的高新技術(shù)研究中心，正與海外的一流學(xué)者進(jìn)行交流。在自然科學(xué)，工程學(xué)，農(nóng)學(xué)以及經(jīng)濟(jì)學(xué)等研究領(lǐng)域，通過(guò)與日本國(guó)際協(xié)力機(jī)構(gòu)(JICA)，日本國(guó)際協(xié)力銀行(JBIC)以及其他機(jī)構(gòu)的合作對(duì)發(fā)展中國(guó)家進(jìn)行大力援助。去年，和聯(lián)合國(guó)教科文組織(UNESCO)簽訂了協(xié)定對(duì)山體滑坡?lián)p害方面的專家進(jìn)行培訓(xùn)，并對(duì)相關(guān)研究進(jìn)行支持援助。作為阿富汗重建家園支援計(jì)劃的一部分，喀布爾大學(xué)醫(yī)學(xué)部教師培訓(xùn)項(xiàng)目正在啟動(dòng)。

京都大學(xué)國(guó)際教育項(xiàng)目(KUINEP)是京都大學(xué)學(xué)生交流計(jì)劃項(xiàng)目之一，該項(xiàng)目為半年或一年的英語(yǔ)講座，涉及生命科學(xué)，環(huán)境科學(xué)研究，生物技術(shù)，統(tǒng)計(jì)學(xué)，物理學(xué)，經(jīng)濟(jì)學(xué)，信息科學(xué)，政治學(xué)，社會(huì)科學(xué)和藝術(shù)。此外雙向的技術(shù)交流一直不斷地在進(jìn)行。京都大學(xué)與環(huán)太平洋大學(xué)聯(lián)盟(APRU)，東亞研究型大學(xué)協(xié)會(huì)(AEARU)等國(guó)際性技術(shù)機(jī)構(gòu)組織建立了緊密的聯(lián)系。從而在該地區(qū)內(nèi)建立了多邊的國(guó)際交流。京都大學(xué)的許多最新研究成果都已經(jīng)被廣泛地介紹到國(guó)外，在海外還主辦了“京都大學(xué)國(guó)際論壇”，旨在通過(guò)與一流研究者的討論擴(kuò)大研究信息的雙向交流。這些研討會(huì)使參與者在信息科學(xué)，經(jīng)濟(jì)學(xué)，能源科學(xué)和心理學(xué)等領(lǐng)域從美國(guó)，英國(guó)和加拿大獲得了寶貴的經(jīng)驗(yàn)。

目前，京都大學(xué)正在計(jì)劃為京都大學(xué)和世界各地的研究者和學(xué)生建立科學(xué)中心，旨在拓寬知識(shí)，探討和世界交流的新途徑。